使用規(guī)模： 木瓜蛋白酶在醫(yī)藥、食物、飲料、化學(xué)試劑、飼料、紡織化妝品等方面都有廣泛的使用，開發(fā)前景寬廣。
食物工業(yè)：在食物行業(yè)中，木瓜蛋白酶可用于肉類嫩化、啤酒弄清、餅干松化等用處。
木瓜蛋白酶在啤酒中的使用：啤酒弄清劑：引起啤酒冷藏混濁時(shí)首要原因是啤酒中的蛋白質(zhì)極易與多元酚結(jié)大分子的復(fù)合物。使用啤酒弄清劑中的木瓜蛋白酶對形成混濁的蛋白質(zhì)有廣泛的特異性，能把大分子的蛋白質(zhì)降解成小分子的物質(zhì)，提高了蛋白質(zhì)與多元酚復(fù)合物的溶解度；另一方面，木瓜蛋白酶是一種具有生物活性的蛋白質(zhì)，該蛋白質(zhì)可與引起啤酒冷藏混濁的多元酚形成穩(wěn)定狀況平衡，防止了啤酒的冷藏混濁。
肉類嫩化劑：使用木瓜蛋白酶能裂解肉類中的膠原蛋白和肌肉纖維，而使肉的結(jié)構(gòu)松散。由于木瓜蛋白酶是半胱氨酰基蛋白酶，能降解膠原纖維和結(jié)締組織蛋白質(zhì)，它將肌動球蛋白和膠原蛋白降解成為小分子的多肽甚至氨基酸, 令肌肉肌絲和筋腰絲斷裂, 使肉類變得嫩滑，并簡化蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)使人體食用后易于消化吸收。
餅干松化劑：使用木瓜蛋白酶的酶促反響, 將面團(tuán)的蛋白質(zhì)降解為小分子的膚或氨基酶, 降低了面團(tuán)的拉伸阻力, 使面團(tuán)變得柔軟、更有可塑性, 減少彈性, 易于成型。用量視餅干廠的加工辦法和面團(tuán)中蛋白質(zhì)的含量不同而不同，研討表明每公斤面添加0.6-1.0萬單位/ 克為佳。
